More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1047 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1047  inner-membrane translocator  100 
 
 		 285 aa  550  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00407323 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1173  inner-membrane translocator  75.46 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0702633 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0978  inner-membrane translocator  67.6 
 
 		 284 aa  387  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.716226 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1317  inner-membrane translocator  68.99 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0499504  normal  0.458714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  31.65 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  33.01 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.12 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  34.54 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  34.54 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  27.54 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 314 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  33.12 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.49 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  29.13 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  29.13 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 313 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  29.9 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  29.82 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 309 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1841  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 306 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1647  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.224801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  30.03 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  26.77 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  27.93 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  28.19 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  27.93 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  26.45 
 
 		 304 aa  92.8  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  28.9 
 
 		 344 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>