More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1841 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1841  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  80.5 
 
 		 296 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  74.25 
 
 		 299 aa  436  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1647  inner-membrane translocator  78.26 
 
 		 299 aa  431  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.224801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 303 aa  188  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  35 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  31.82 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  32.49 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  32.49 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 305 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  32.93 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  33.11 
 
 		 344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  33.11 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  35.37 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.66 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 445 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.15 
 
 		 425 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.23 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  34.65 
 
 		 435 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2022  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>