279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0978 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0978  inner-membrane translocator  100 
 
 		 284 aa  556  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.716226 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1317  inner-membrane translocator  71.18 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0499504  normal  0.458714 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1173  inner-membrane translocator  70.63 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0702633 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1047  inner-membrane translocator  67.6 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00407323 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  32.57 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.45 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  32.19 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1841  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  28.06 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1647  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.224801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  28 
 
 		 314 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 319 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  29.13 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  29.13 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  27.92 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 309 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.67 
 
 		 314 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  26.23 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2022  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  29.87 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  29.87 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  28.26 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 309 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  29.41 
 
 		 304 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  28.57 
 
 		 344 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 425 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1115  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  26.13 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  25.17 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.52 
 
 		 322 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  27.06 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>