More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0893 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  100 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  83.15 
 
 		 267 aa  461  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  83.52 
 
 		 267 aa  456  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  82.09 
 
 		 268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  41.47 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  43.87 
 
 		 592 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.23 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  39.38 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.51 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  38.26 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  38.34 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  38.17 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  37.4 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.75 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.75 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  38.17 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  39.44 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  40.32 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  40.88 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  39.56 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  40.43 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  43.2 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.26 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  41.43 
 
 		 303 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  39.13 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  38.74 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  43.89 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  38.74 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  40.16 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.8 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  42.53 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  38.62 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  42.34 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  37.94 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  42.08 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  42.08 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  42.53 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  42.08 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  42.02 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  35.11 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  40.16 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  39.44 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  38.89 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  40.59 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  40 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  36.61 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  38.8 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  40.17 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  39.59 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  37.45 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  38.58 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  38.22 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.2 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  41.18 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  39.92 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  39.45 
 
 		 689 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  37.12 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  33.71 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  37.13 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  36.07 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  38.06 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  37.72 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  38.04 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  37.5 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  37.05 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  37.3 
 
 		 301 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  41.52 
 
 		 626 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  39.24 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  36.84 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  38 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  38.1 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  40.09 
 
 		 624 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  43.63 
 
 		 622 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  38.04 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  38.89 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  36.82 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  39.64 
 
 		 629 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  36.11 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  36.23 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  37.6 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  32.39 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  40.25 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  36.16 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  34.87 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  37.56 
 
 		 614 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  40.25 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  35.91 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  40.25 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  40.25 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  40.25 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  40.25 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  36.14 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  38.91 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  35.45 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  39.83 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  37.74 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  36.03 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  33.08 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>