More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2619 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  88.06 
 
 		 201 aa  362  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  85.07 
 
 		 201 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  44.33 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  39.7 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 200 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  30.1 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  25.44 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  30.73 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.11 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.63 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.93 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.12 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.12 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  28.66 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  28 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.71 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.33 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.53 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.74 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  25.49 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  27.81 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.4 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  27.83 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.76 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 		 259 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 		 271 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.14 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.6 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.37 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.37 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.37 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  26.47 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.49 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  23.5 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  26.19 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  26.19 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  26.19 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  26.19 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 254 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.36 
 
 		 274 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  26.19 
 
 		 270 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 		 248 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  26.19 
 
 		 240 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  28.78 
 
 		 901 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>