274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0791 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 303 aa  620  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  65.13 
 
 		 269 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  53.36 
 
 		 287 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  46.72 
 
 		 296 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  45.02 
 
 		 302 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  44.16 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  43.25 
 
 		 303 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  42.05 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  44.24 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  44.24 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  43.88 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  43.88 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  42.6 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  43.68 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  43.32 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  43.32 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  40.57 
 
 		 298 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  42.6 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  42.2 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  42.2 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  42.2 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  41.49 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  41.13 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  41.49 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  41.13 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  40.78 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  41.72 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  41.18 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  40 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  35.62 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  36.56 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  28.16 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.58 
 
 		 820 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.9 
 
 		 988 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.75 
 
 		 784 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.31 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.62 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 632 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.23 
 
 		 818 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.48 
 
 		 1056 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 3145 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  27.52 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.65 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.65 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 1421 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.03 
 
 		 706 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 543 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 556 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.2 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.56 
 
 		 542 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 822 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1276 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 836 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 4079 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 452 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 890 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1094 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 878 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 1192 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 511 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.14 
 
 		 738 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 232 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.39 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 761 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>