More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0149 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0149  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 380 aa  770    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1188  extracellular solute-binding protein  70.65 
 
 		 381 aa  547  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0139  extracellular solute-binding protein  70.85 
 
 		 374 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0201839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0120  extracellular solute-binding protein  69.07 
 
 		 364 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  44.64 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  34.17 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  35.87 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  36.62 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  35.99 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  33.82 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  35.67 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  33.96 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.45 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  36.13 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  35.24 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.71 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  34.65 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  35.35 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  35.35 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  34.33 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2135  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  34.26 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.94 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  32.73 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  35.71 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  31.77 
 
 		 369 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2984  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.746343 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.44 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2225  extracellular solute-binding protein family 1  33.02 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  35.13 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  33.78 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 366 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1501  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  33.89 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  33.53 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  32.55 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  32.57 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3260  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  32.28 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1241  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.447743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.82 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  31.86 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  30.46 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  33.53 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2779  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.37 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  34.23 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  34.23 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  30.81 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  33.45 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 375 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4671  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  31.27 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04220  putative binding protein component of ABC transporter  33.87 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  31.76 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  32.22 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  32.8 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>