More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04698 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  100 
 
 
268 aa  541  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  53.57 
 
 
320 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.06 
 
 
320 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  52 
 
 
316 aa  254  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  51.68 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  49.6 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  51.68 
 
 
316 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  51.68 
 
 
247 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  52.68 
 
 
310 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  49.2 
 
 
316 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  51.71 
 
 
310 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  51.71 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  51.71 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  51.71 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  51.71 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  52.68 
 
 
310 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  51.28 
 
 
311 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  49.01 
 
 
277 aa  241  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  44.12 
 
 
261 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  29.37 
 
 
463 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  30.21 
 
 
459 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.67 
 
 
707 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  31.62 
 
 
464 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  29.91 
 
 
464 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  31.2 
 
 
464 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  30.11 
 
 
463 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  54.22 
 
 
85 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  54.22 
 
 
85 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.74 
 
 
319 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  28.21 
 
 
464 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  36.43 
 
 
424 aa  92  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  26.92 
 
 
464 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  48.48 
 
 
533 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  38.02 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.83 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.83 
 
 
237 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
490 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
240 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
247 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
236 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  26.81 
 
 
537 aa  89  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
240 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 
187 aa  89  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
456 aa  89  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 
218 aa  88.6  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
222 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 
218 aa  88.6  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 
219 aa  88.6  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  38.46 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  43.8 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  38.46 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  42.31 
 
 
402 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
543 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.57 
 
 
212 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
215 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 
188 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
215 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.54 
 
 
294 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  36.89 
 
 
215 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.33 
 
 
609 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.59 
 
 
214 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
544 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
458 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 
227 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 
219 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
230 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.04 
 
 
533 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  38.46 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  36.89 
 
 
217 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  28.49 
 
 
729 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  37.04 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 
498 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.78 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 
230 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.58 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
704 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  41.18 
 
 
558 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.05 
 
 
542 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  35.34 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 
673 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  37.5 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  42.2 
 
 
631 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.83 
 
 
510 aa  82.8  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  36.89 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 
412 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.98 
 
 
525 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>