148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3533 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  100 
 
 		 392 aa  792    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  89.54 
 
 		 392 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  64.16 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  63.9 
 
 		 395 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  66.75 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 759 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  21.7 
 
 		 797 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 763 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 765 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 747 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 		 761 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 789 aa  72.8  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  22.28 
 
 		 759 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  24.24 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  19.06 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  21.38 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  28.64 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  25.83 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 774 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.51 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 375 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  27.32 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  26.96 
 
 		 598 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  24.86 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 448 aa  50.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 382 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  27.62 
 
 		 417 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.49 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  18.72 
 
 		 756 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  21.82 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  19.55 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.31 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.36 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 366 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>