More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4911 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4911  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  507  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.803448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56430  putative transcriptional regulator  94.14 
 
 		 256 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1294  IclR family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 256 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2552  IclR family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2750  IclR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2608  regulatory protein, IclR  62.75 
 
 		 257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  38.18 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.04 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.48 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  24.9 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.78 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.78 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  36.88 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.34 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.36 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  26.36 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.36 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.36 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  26.36 
 
 		 315 aa  62  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.17 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  35.33 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  30.4 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  34.57 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  35.9 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  24.63 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  29.62 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  30 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  28.39 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  28.39 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.81 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  28.49 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  28.75 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.38 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  31.13 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  31.13 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  24.22 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  28.42 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  31.13 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  31.13 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  31.13 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  25.75 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  23.98 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6477  regulatory protein, IclR  30.43 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.47 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  24.49 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3604  IclR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83328  normal  0.323087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1787  transcriptional regulator, putative  29.63 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000180393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.39 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>