More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4371 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  72.53 
 
 		 295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  71.76 
 
 		 267 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.47 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 		 254 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  59.55 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  56.49 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  58.82 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.87 
 
 		 267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.43 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  55.73 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  58.43 
 
 		 261 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  54.72 
 
 		 278 aa  298  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  58.04 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  55.37 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  57.94 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.57 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.59 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.72 
 
 		 260 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  56.69 
 
 		 254 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 		 260 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 		 592 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.87 
 
 		 245 aa  275  7e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  55.95 
 
 		 256 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  55 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.34 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  52.85 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  55.12 
 
 		 259 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.75 
 
 		 254 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54.18 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.39 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.05 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.6 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  53.2 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.11 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  53.78 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  55.02 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.4 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  52.4 
 
 		 250 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  55.51 
 
 		 255 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  53.63 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  53.1 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  54.15 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.8 
 
 		 244 aa  265  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.78 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  53.75 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  54.62 
 
 		 244 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  54.37 
 
 		 268 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.54 
 
 		 595 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  52.17 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  54.62 
 
 		 261 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.82 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  51.78 
 
 		 257 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  53.63 
 
 		 288 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.2 
 
 		 245 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.11 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  51.35 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  56 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  52.57 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  55.16 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  52.38 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  54.8 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  54 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  54.8 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  53.57 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  56.18 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.71 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  54.84 
 
 		 254 aa  258  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54 
 
 		 243 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  51.92 
 
 		 265 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.8 
 
 		 240 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  52.36 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  50.59 
 
 		 246 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  56.18 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.3 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  52.38 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  54.84 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 		 257 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  50.91 
 
 		 279 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  52.85 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>