149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3914 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  92.61 
 
 		 203 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  75.13 
 
 		 197 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  70.85 
 
 		 197 aa  267  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  68.5 
 
 		 199 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  65.84 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  64.97 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  64.47 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  69 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  65.48 
 
 		 199 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  63.45 
 
 		 199 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  40.31 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  38.61 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  39.79 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  40.4 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  39.27 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  37.44 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  34.98 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  41.48 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  36.5 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  44.68 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  40.34 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  36.36 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  35.82 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  37.5 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  35.05 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  41.84 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  33.17 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  40.85 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  42.5 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  36.65 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  37.97 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  41.94 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  38.3 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  41.67 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  33.88 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  41.49 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  31.86 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  38.78 
 
 		 215 aa  104  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  32.49 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  41.58 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  37.5 
 
 		 241 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  37.37 
 
 		 227 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  38.38 
 
 		 227 aa  95.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  34.12 
 
 		 171 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  35.29 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  37.2 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  38.66 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  40.91 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  29.65 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  34.67 
 
 		 243 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  35.03 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  34.01 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  38.73 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  35.5 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  32.39 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  29.73 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  33.5 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  29.09 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  31.02 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  31.69 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  33.33 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  31.98 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  38.15 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  30.88 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  37.57 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  31.9 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  31.9 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  33.16 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  31.9 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  32.72 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  31.29 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  31.29 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  31.29 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  31.29 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  28.65 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  31.29 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  31.29 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  28.79 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  30.06 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  31.11 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  29.45 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  30.25 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  27.89 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  30.39 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  27.18 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  32.09 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  30.67 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  25.89 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  30.06 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  32.4 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  30.06 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  28.66 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>