More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1955 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  94.21 
 
 		 242 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  43.53 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  43.7 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  43.1 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  43.64 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  39.57 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 268 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  23.14 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 254 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 280 aa  85.1  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  31.82 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  28.8 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  29.67 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  32.39 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  30.15 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  25.91 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.89 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.45 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.94 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  31.39 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  27.92 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  32.08 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  26.42 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.36 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  25.68 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.96 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.6 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.96 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.25 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 550 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  26.23 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.73 
 
 		 254 aa  72  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>