More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85570 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.27 
 
 
1517 aa  941    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.82 
 
 
1478 aa  899    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  52.29 
 
 
1498 aa  1503    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.16 
 
 
1480 aa  905    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  52.23 
 
 
1501 aa  1546    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  47.13 
 
 
1462 aa  1387    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  38.65 
 
 
1425 aa  992    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.69 
 
 
1457 aa  925    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.8 
 
 
1361 aa  910    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.47 
 
 
1448 aa  850    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  46.44 
 
 
1466 aa  1324    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  52.09 
 
 
1499 aa  1509    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  44.88 
 
 
1490 aa  1252    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  44.31 
 
 
1486 aa  1268    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  41.79 
 
 
1455 aa  1115    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  100 
 
 
1505 aa  3148    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  59.54 
 
 
1445 aa  1870    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  38.69 
 
 
1543 aa  868    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  37.63 
 
 
1463 aa  886    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  34.05 
 
 
1420 aa  805    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  33.38 
 
 
1421 aa  798    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  49.57 
 
 
1536 aa  1513    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  51.37 
 
 
1558 aa  1491    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  61 
 
 
1476 aa  1924    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  59.79 
 
 
1470 aa  1825    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  27.37 
 
 
1367 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  27.23 
 
 
1268 aa  410  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  33.57 
 
 
1164 aa  272  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  33.63 
 
 
1186 aa  264  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  24.7 
 
 
1271 aa  185  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  26.37 
 
 
641 aa  173  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  40.47 
 
 
515 aa  169  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  37.37 
 
 
963 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  26.58 
 
 
1033 aa  166  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  25.43 
 
 
589 aa  165  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  28.05 
 
 
741 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  27.83 
 
 
602 aa  164  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  37.73 
 
 
1090 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  39.53 
 
 
635 aa  161  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  28.39 
 
 
551 aa  160  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.73 
 
 
585 aa  159  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  29.96 
 
 
545 aa  155  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  23.52 
 
 
640 aa  155  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  35.1 
 
 
655 aa  152  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  29.49 
 
 
1253 aa  149  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  25.2 
 
 
559 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  25.54 
 
 
523 aa  148  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.19 
 
 
664 aa  144  9e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  35.79 
 
 
641 aa  140  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.5 
 
 
1004 aa  139  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 
1275 aa  136  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.23 
 
 
890 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  38.53 
 
 
796 aa  132  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.96 
 
 
556 aa  132  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  40.89 
 
 
1108 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.37 
 
 
910 aa  129  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.46 
 
 
777 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  39.22 
 
 
770 aa  123  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  38.24 
 
 
515 aa  123  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  25.41 
 
 
640 aa  123  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.99 
 
 
802 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 
861 aa  122  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  35.19 
 
 
869 aa  121  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.26 
 
 
799 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  35.48 
 
 
863 aa  119  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.26 
 
 
799 aa  120  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  30.98 
 
 
810 aa  119  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
863 aa  119  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  31.84 
 
 
866 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  31.84 
 
 
866 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  31.84 
 
 
866 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.06 
 
 
899 aa  117  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  39.02 
 
 
851 aa  115  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  37.25 
 
 
242 aa  115  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.38 
 
 
838 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
851 aa  114  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  35.82 
 
 
848 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.24 
 
 
878 aa  113  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.06 
 
 
903 aa  113  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  33.33 
 
 
253 aa  106  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  35.48 
 
 
895 aa  105  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.57 
 
 
856 aa  104  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.98 
 
 
933 aa  101  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  26.09 
 
 
1194 aa  96.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  31.13 
 
 
702 aa  95.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 
251 aa  93.2  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.06 
 
 
849 aa  93.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  31.6 
 
 
246 aa  92.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  29.27 
 
 
242 aa  92.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  31.73 
 
 
243 aa  90.9  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.13 
 
 
764 aa  87.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  27.95 
 
 
580 aa  87.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  30.96 
 
 
247 aa  87  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  30.77 
 
 
297 aa  87  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  30.29 
 
 
242 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.03 
 
 
324 aa  86.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  30.73 
 
 
244 aa  86.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  29.44 
 
 
243 aa  86.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.63 
 
 
547 aa  85.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  32.34 
 
 
255 aa  85.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>