More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82629 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  100 
 
 		 589 aa  1213    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  50.36 
 
 		 559 aa  530  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  28.6 
 
 		 1463 aa  216  8e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  25.74 
 
 		 640 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  27.6 
 
 		 640 aa  213  7.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  29.76 
 
 		 1253 aa  207  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.58 
 
 		 585 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  28.4 
 
 		 1425 aa  203  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  25.09 
 
 		 1543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.69 
 
 		 1480 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  27.38 
 
 		 641 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  29.5 
 
 		 1271 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  28.05 
 
 		 1466 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  28.29 
 
 		 602 aa  194  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  26.2 
 
 		 741 aa  193  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  28.01 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.47 
 
 		 1517 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.375174 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  26.2 
 
 		 523 aa  190  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.21 
 
 		 1361 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  25.28 
 
 		 635 aa  189  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  28.55 
 
 		 1470 aa  187  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.1 
 
 		 1457 aa  186  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  36.91 
 
 		 963 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.25 
 
 		 1490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  32.22 
 
 		 664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  26.09 
 
 		 1558 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  26.39 
 
 		 641 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  39.23 
 
 		 1090 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  39.45 
 
 		 1033 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  37.6 
 
 		 242 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  26.47 
 
 		 1455 aa  180  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.51 
 
 		 1448 aa  180  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  26.42 
 
 		 1536 aa  180  7e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  28.57 
 
 		 551 aa  180  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  25.73 
 
 		 515 aa  180  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.57 
 
 		 1478 aa  179  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.833442 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  28.4 
 
 		 1499 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  30.02 
 
 		 655 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  28.1 
 
 		 1498 aa  178  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  26 
 
 		 1420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  25.63 
 
 		 1367 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  26.32 
 
 		 1186 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  26.75 
 
 		 1268 aa  171  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 1275 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  26.43 
 
 		 1421 aa  166  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  27.09 
 
 		 1164 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  25.43 
 
 		 1505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  25.44 
 
 		 1501 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  27.49 
 
 		 1445 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  26.83 
 
 		 1476 aa  163  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.07 
 
 		 1486 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  27.18 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  35.34 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.95 
 
 		 1462 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  31.97 
 
 		 810 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  35.32 
 
 		 253 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  25.67 
 
 		 796 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.36 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  34.3 
 
 		 256 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  36.02 
 
 		 316 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 312 aa  110  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  31.72 
 
 		 253 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 253 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  31.72 
 
 		 253 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 253 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 256 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.65 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  30.88 
 
 		 861 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  30.88 
 
 		 869 aa  107  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  31.13 
 
 		 259 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  34.03 
 
 		 259 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  23.82 
 
 		 1004 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.76 
 
 		 536 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.91 
 
 		 910 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 302 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  25.58 
 
 		 866 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 302 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  30.77 
 
 		 279 aa  105  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  30.21 
 
 		 330 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 		 866 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  25.58 
 
 		 866 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  33.05 
 
 		 266 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  32.27 
 
 		 279 aa  104  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  31.03 
 
 		 222 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  31.03 
 
 		 222 aa  103  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  30.33 
 
 		 317 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  31.03 
 
 		 222 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.06 
 
 		 339 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 223 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  29.63 
 
 		 261 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  28.95 
 
 		 231 aa  103  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 253 aa  103  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  29.67 
 
 		 352 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  29.71 
 
 		 259 aa  103  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 		 256 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  27.1 
 
 		 341 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  28.64 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.74 
 
 		 777 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.61 
 
 		 856 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  34.41 
 
 		 316 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>