More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00680 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.51 
 
 
1517 aa  897    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.88 
 
 
1478 aa  768    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  34.01 
 
 
1498 aa  830    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.3 
 
 
1480 aa  840    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  32.58 
 
 
1501 aa  767    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.58 
 
 
1462 aa  816    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  36.84 
 
 
1425 aa  895    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.21 
 
 
1457 aa  798    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.84 
 
 
1361 aa  820    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  32.74 
 
 
1448 aa  798    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  33.95 
 
 
1466 aa  822    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  34.21 
 
 
1499 aa  817    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.6 
 
 
1490 aa  768    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  32.77 
 
 
1486 aa  734    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  35.89 
 
 
1543 aa  779    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  36.1 
 
 
1463 aa  820    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  100 
 
 
1420 aa  2942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  87.53 
 
 
1421 aa  2606    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  34.8 
 
 
1536 aa  800    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.72 
 
 
1558 aa  806    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  33.85 
 
 
1505 aa  789    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  33.26 
 
 
1470 aa  769    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  33.21 
 
 
1445 aa  771    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  34.51 
 
 
1455 aa  827    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  32.3 
 
 
1476 aa  760    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  27.68 
 
 
1367 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  27.32 
 
 
1268 aa  367  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  24.9 
 
 
1164 aa  310  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  26.5 
 
 
1186 aa  304  8.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  25.28 
 
 
1271 aa  234  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  24.62 
 
 
1253 aa  224  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  26 
 
 
589 aa  175  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  29.14 
 
 
585 aa  171  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  30.5 
 
 
602 aa  171  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  29 
 
 
641 aa  168  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  30.11 
 
 
635 aa  166  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  39.06 
 
 
963 aa  161  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  28.54 
 
 
515 aa  160  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.72 
 
 
523 aa  159  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  31.99 
 
 
655 aa  154  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  37.45 
 
 
1090 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  28.95 
 
 
515 aa  149  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  26.15 
 
 
641 aa  148  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  24.7 
 
 
1033 aa  146  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  23.84 
 
 
559 aa  145  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  37.31 
 
 
545 aa  145  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  28.5 
 
 
1275 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  23.95 
 
 
640 aa  134  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.05 
 
 
664 aa  133  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  30.56 
 
 
551 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  24.16 
 
 
741 aa  126  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  35.48 
 
 
242 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  22.59 
 
 
810 aa  119  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  34.88 
 
 
863 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  35.75 
 
 
796 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  25.43 
 
 
640 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.14 
 
 
777 aa  111  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  33.64 
 
 
866 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  33.88 
 
 
1108 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 
866 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  33.64 
 
 
866 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  32.74 
 
 
861 aa  109  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  32.74 
 
 
869 aa  108  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.19 
 
 
890 aa  108  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.23 
 
 
851 aa  106  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.72 
 
 
1004 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  25.78 
 
 
851 aa  105  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  22.75 
 
 
556 aa  104  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.56 
 
 
799 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.56 
 
 
799 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.94 
 
 
802 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  35.05 
 
 
770 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31 
 
 
838 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.32 
 
 
910 aa  100  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  30.84 
 
 
848 aa  95.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  33.18 
 
 
972 aa  95.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  32.07 
 
 
895 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.04 
 
 
856 aa  94.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.54 
 
 
933 aa  93.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.54 
 
 
849 aa  90.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  22.91 
 
 
878 aa  89.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.74 
 
 
863 aa  89.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0313  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  31.19 
 
 
430 aa  84.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.74 
 
 
374 aa  84  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  30.63 
 
 
269 aa  84  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  30.63 
 
 
266 aa  83.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
253 aa  82.8  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.05 
 
 
899 aa  82.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  27.92 
 
 
264 aa  82.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  32.04 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.04 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
252 aa  82  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.63 
 
 
903 aa  81.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.93 
 
 
292 aa  81.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  29.69 
 
 
244 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  26.72 
 
 
632 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.16 
 
 
541 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  33.69 
 
 
318 aa  80.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  29.33 
 
 
243 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  32.63 
 
 
244 aa  80.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>