More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33002 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  45.66 
 
 
963 aa  825    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  100 
 
 
1033 aa  2121    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  48.17 
 
 
1090 aa  562  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  32.48 
 
 
551 aa  280  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  31.66 
 
 
585 aa  251  6e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  29.61 
 
 
640 aa  239  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  29.34 
 
 
602 aa  231  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  27.36 
 
 
741 aa  228  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  31.09 
 
 
664 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  28.09 
 
 
556 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  28.4 
 
 
635 aa  199  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.33 
 
 
1361 aa  195  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  26.82 
 
 
1253 aa  194  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  26.86 
 
 
589 aa  194  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  27.29 
 
 
1425 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  24.83 
 
 
1463 aa  189  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  31.3 
 
 
523 aa  189  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  39.52 
 
 
515 aa  187  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  27.49 
 
 
1558 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.39 
 
 
1457 aa  186  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  25.8 
 
 
1498 aa  185  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  26.85 
 
 
1271 aa  184  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
1275 aa  184  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.99 
 
 
1517 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  37.18 
 
 
641 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  25.43 
 
 
1501 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.31 
 
 
1490 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  26.75 
 
 
1536 aa  181  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  25.22 
 
 
1421 aa  180  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  28.04 
 
 
1186 aa  177  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.02 
 
 
1462 aa  174  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  25.77 
 
 
1499 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  39.58 
 
 
242 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  26.58 
 
 
1505 aa  172  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  25.26 
 
 
1476 aa  172  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.68 
 
 
1486 aa  170  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  24.78 
 
 
1470 aa  170  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  21.99 
 
 
1448 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  27.3 
 
 
559 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  25.59 
 
 
655 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  27.01 
 
 
1466 aa  166  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  25.3 
 
 
1367 aa  165  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  24.63 
 
 
1420 aa  164  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  24.79 
 
 
1445 aa  163  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  23.16 
 
 
1455 aa  158  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  25.3 
 
 
810 aa  156  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  38.04 
 
 
1164 aa  156  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  34.2 
 
 
1268 aa  154  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  24.3 
 
 
1543 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  38.27 
 
 
545 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.92 
 
 
1480 aa  151  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.88 
 
 
1478 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  24.76 
 
 
640 aa  146  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  35.86 
 
 
515 aa  145  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.56 
 
 
899 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.51 
 
 
903 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.82 
 
 
878 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  34.68 
 
 
253 aa  132  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  36.67 
 
 
1108 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.75 
 
 
1004 aa  131  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.78 
 
 
863 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.91 
 
 
890 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  29.52 
 
 
641 aa  127  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  38.17 
 
 
770 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.86 
 
 
802 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.16 
 
 
910 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 
231 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  24.62 
 
 
796 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  34.16 
 
 
851 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  32.16 
 
 
895 aa  121  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  29.46 
 
 
1194 aa  120  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
933 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.29 
 
 
777 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
856 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0341  ABC transporter related protein  35.39 
 
 
251 aa  118  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.61 
 
 
838 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
252 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  34.91 
 
 
235 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  35 
 
 
231 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  34.43 
 
 
253 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  34.43 
 
 
253 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
253 aa  112  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.16 
 
 
851 aa  112  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  32.57 
 
 
866 aa  112  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  32.26 
 
 
861 aa  111  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.58 
 
 
849 aa  111  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 
253 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  32.26 
 
 
869 aa  111  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  33.18 
 
 
217 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
231 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  33.91 
 
 
268 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 
253 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 
253 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  33.04 
 
 
228 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  32.57 
 
 
866 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  32.57 
 
 
866 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.43 
 
 
799 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  33.8 
 
 
252 aa  109  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>