More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07090 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  39.54 
 
 
1517 aa  1083    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  39.04 
 
 
1478 aa  962    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  37.61 
 
 
1498 aa  955    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  48.53 
 
 
1480 aa  1430    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  38.88 
 
 
1501 aa  948    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  38.4 
 
 
1462 aa  913    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  40.31 
 
 
1425 aa  1035    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  40.06 
 
 
1457 aa  998    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  39.84 
 
 
1361 aa  989    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.54 
 
 
1448 aa  934    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  38.56 
 
 
1466 aa  974    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  38.74 
 
 
1499 aa  967    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  38 
 
 
1490 aa  921    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.9 
 
 
1486 aa  836    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  38.33 
 
 
1505 aa  903    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  37.28 
 
 
1476 aa  897    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  100 
 
 
1543 aa  3199    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  39.18 
 
 
1463 aa  999    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  35.89 
 
 
1420 aa  839    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  36.09 
 
 
1421 aa  846    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  38.33 
 
 
1536 aa  947    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  38.81 
 
 
1558 aa  942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  37.02 
 
 
1455 aa  969    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  36.74 
 
 
1445 aa  892    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  38.63 
 
 
1470 aa  920    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  27.89 
 
 
1268 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  28.53 
 
 
1367 aa  419  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  26.63 
 
 
1164 aa  366  2e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  33.4 
 
 
1186 aa  246  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  23.23 
 
 
1271 aa  243  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  25.09 
 
 
589 aa  199  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  29.11 
 
 
641 aa  184  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  29.5 
 
 
602 aa  181  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  26.89 
 
 
523 aa  179  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  29.37 
 
 
515 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  28.47 
 
 
635 aa  176  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  29.32 
 
 
655 aa  172  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  28.6 
 
 
585 aa  169  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  29.29 
 
 
545 aa  162  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  33.74 
 
 
963 aa  162  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  37.41 
 
 
1090 aa  160  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  25.43 
 
 
741 aa  158  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  24.56 
 
 
640 aa  157  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  24.26 
 
 
559 aa  155  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.5 
 
 
551 aa  153  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  28.15 
 
 
664 aa  149  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  34.49 
 
 
1033 aa  149  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  35.97 
 
 
641 aa  148  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  25.91 
 
 
1253 aa  147  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
1275 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.92 
 
 
556 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  26.44 
 
 
515 aa  134  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  26.61 
 
 
1004 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.27 
 
 
890 aa  125  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  36.36 
 
 
242 aa  123  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  25.19 
 
 
640 aa  121  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  25.93 
 
 
810 aa  118  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  37.9 
 
 
796 aa  118  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.53 
 
 
777 aa  117  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.42 
 
 
910 aa  113  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  33.82 
 
 
1108 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.44 
 
 
802 aa  110  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  35.45 
 
 
770 aa  108  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  27.92 
 
 
851 aa  107  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
848 aa  107  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  32.19 
 
 
861 aa  106  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.38 
 
 
799 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  31.62 
 
 
869 aa  105  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.94 
 
 
838 aa  104  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.91 
 
 
799 aa  104  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.27 
 
 
856 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  31.29 
 
 
863 aa  103  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.27 
 
 
933 aa  103  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.26 
 
 
863 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  31.22 
 
 
866 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  31.22 
 
 
866 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  35.71 
 
 
895 aa  100  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  31.53 
 
 
866 aa  99.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.51 
 
 
851 aa  99.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  28.42 
 
 
702 aa  97.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.49 
 
 
878 aa  95.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.74 
 
 
899 aa  91.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.21 
 
 
903 aa  90.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.48 
 
 
849 aa  90.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  28.57 
 
 
253 aa  86.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  33.18 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  33.18 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  25.58 
 
 
1194 aa  82.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  34.27 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.02 
 
 
291 aa  79.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  28.95 
 
 
588 aa  79.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  34.57 
 
 
339 aa  79  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  31.1 
 
 
457 aa  78.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  31.9 
 
 
263 aa  78.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  27.21 
 
 
571 aa  78.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  29.81 
 
 
308 aa  77.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  34.63 
 
 
340 aa  77.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3101  ABC transporter related protein  30.96 
 
 
241 aa  77.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  30.48 
 
 
308 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  30.48 
 
 
308 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>