More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04860 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  45.18 
 
 
963 aa  802    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  100 
 
 
1090 aa  2243    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  48.17 
 
 
1033 aa  567  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  42.4 
 
 
664 aa  187  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  42.41 
 
 
585 aa  187  9e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  40.21 
 
 
602 aa  185  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  39.23 
 
 
589 aa  182  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  42.22 
 
 
1425 aa  178  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  33.5 
 
 
741 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  41.42 
 
 
1457 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  34.45 
 
 
515 aa  176  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  38.81 
 
 
1186 aa  174  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  37.59 
 
 
1499 aa  171  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  37.88 
 
 
641 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  37.91 
 
 
1536 aa  170  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  37.28 
 
 
1558 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  38.17 
 
 
1490 aa  168  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  36.27 
 
 
1501 aa  167  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  42.97 
 
 
551 aa  168  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  40.08 
 
 
242 aa  165  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  37.73 
 
 
1505 aa  164  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  38.75 
 
 
1470 aa  163  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  38.58 
 
 
1463 aa  163  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  34.27 
 
 
1367 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.3 
 
 
1462 aa  163  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  38.29 
 
 
635 aa  163  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  38.31 
 
 
1164 aa  162  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  40.71 
 
 
640 aa  162  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  40.84 
 
 
1361 aa  162  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  38.1 
 
 
1476 aa  162  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  36.86 
 
 
1498 aa  161  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  37.41 
 
 
1543 aa  161  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  38.35 
 
 
1478 aa  161  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.29 
 
 
1517 aa  161  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  37.32 
 
 
1445 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  34.96 
 
 
1275 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  40.38 
 
 
1480 aa  159  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.41 
 
 
1486 aa  158  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  36.75 
 
 
1253 aa  158  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  36.23 
 
 
1271 aa  157  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  38.76 
 
 
1466 aa  157  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  37.97 
 
 
515 aa  157  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  35.34 
 
 
1268 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  37.16 
 
 
1455 aa  155  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  33.44 
 
 
641 aa  154  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  38.78 
 
 
545 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  35.77 
 
 
523 aa  151  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  37.45 
 
 
1420 aa  151  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  36.36 
 
 
559 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  37.45 
 
 
1421 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  41.38 
 
 
556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  37.4 
 
 
655 aa  148  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  32.45 
 
 
1448 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  32.65 
 
 
640 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  40.55 
 
 
1108 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  33.33 
 
 
253 aa  129  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  33.33 
 
 
810 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.02 
 
 
1004 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.81 
 
 
890 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  34.39 
 
 
796 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  30.83 
 
 
1194 aa  115  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  34.62 
 
 
851 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  35 
 
 
895 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.65 
 
 
933 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.85 
 
 
838 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  36.7 
 
 
770 aa  115  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.8 
 
 
910 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
848 aa  114  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.64 
 
 
856 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  33.64 
 
 
866 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  34.55 
 
 
863 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 
866 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  33.64 
 
 
866 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.04 
 
 
878 aa  111  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  33.64 
 
 
869 aa  111  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  33.64 
 
 
861 aa  111  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.23 
 
 
802 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.65 
 
 
777 aa  111  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  30.87 
 
 
333 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.94 
 
 
851 aa  109  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.61 
 
 
849 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1713  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
219 aa  109  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
252 aa  108  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
799 aa  108  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
799 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  30.71 
 
 
301 aa  107  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  30.18 
 
 
228 aa  107  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.2 
 
 
307 aa  107  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  27.68 
 
 
243 aa  106  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  30.17 
 
 
246 aa  107  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  31.2 
 
 
253 aa  105  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  31.2 
 
 
253 aa  105  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0341  ABC transporter related protein  34.96 
 
 
251 aa  105  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.59 
 
 
863 aa  105  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  34.91 
 
 
228 aa  105  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  31.4 
 
 
342 aa  105  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.91 
 
 
373 aa  105  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 
616 aa  105  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0986  ABC transporter, ATPase subunit  33.64 
 
 
232 aa  104  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 
231 aa  104  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>