More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32571 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  100 
 
 
1253 aa  2561    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  54.75 
 
 
1271 aa  1450    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  25.53 
 
 
1425 aa  291  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.4 
 
 
1361 aa  273  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
1275 aa  273  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.66 
 
 
1480 aa  267  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.84 
 
 
1462 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.89 
 
 
1517 aa  261  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  23.45 
 
 
1501 aa  261  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.68 
 
 
1457 aa  259  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  24.85 
 
 
1463 aa  252  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  24.03 
 
 
1268 aa  244  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  24.7 
 
 
1420 aa  241  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  25.61 
 
 
1186 aa  239  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  24.1 
 
 
1445 aa  238  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  24.06 
 
 
1466 aa  236  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  23.86 
 
 
1470 aa  234  5e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  24.36 
 
 
1476 aa  233  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  24.67 
 
 
1367 aa  233  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  23.67 
 
 
1455 aa  231  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.81 
 
 
1448 aa  231  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  29.43 
 
 
602 aa  231  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  24.43 
 
 
1421 aa  228  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  24 
 
 
1498 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  23.89 
 
 
1164 aa  222  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  29.76 
 
 
589 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  24.75 
 
 
1558 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.52 
 
 
1478 aa  211  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  30.27 
 
 
585 aa  205  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  32.83 
 
 
551 aa  201  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.48 
 
 
1490 aa  197  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  27.77 
 
 
641 aa  196  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  30.24 
 
 
559 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  28.81 
 
 
741 aa  194  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  29.21 
 
 
640 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  26.75 
 
 
635 aa  189  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  31.59 
 
 
556 aa  185  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  26.83 
 
 
515 aa  184  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  26.82 
 
 
1033 aa  184  9.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  27.48 
 
 
655 aa  183  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  27.74 
 
 
640 aa  179  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  30.48 
 
 
664 aa  179  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  31.64 
 
 
545 aa  177  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  26.64 
 
 
523 aa  175  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  26.37 
 
 
810 aa  172  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  36.43 
 
 
1090 aa  168  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  32.97 
 
 
963 aa  166  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  28.44 
 
 
515 aa  162  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  26.45 
 
 
1543 aa  157  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  38.4 
 
 
242 aa  152  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  29.49 
 
 
1505 aa  149  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  27.73 
 
 
641 aa  141  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
796 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  24.38 
 
 
1536 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  33.33 
 
 
1108 aa  135  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.35 
 
 
1486 aa  134  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.97 
 
 
802 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  24.34 
 
 
1499 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  26.59 
 
 
856 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.06 
 
 
910 aa  128  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.08 
 
 
890 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.7 
 
 
849 aa  127  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.48 
 
 
933 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  28.83 
 
 
851 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.92 
 
 
863 aa  121  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  24.72 
 
 
1194 aa  120  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  34.27 
 
 
253 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.03 
 
 
777 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.48 
 
 
799 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.42 
 
 
1004 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.88 
 
 
878 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.74 
 
 
799 aa  118  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  28.52 
 
 
895 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.9 
 
 
838 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  32.74 
 
 
770 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.84 
 
 
899 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.56 
 
 
903 aa  115  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  29.69 
 
 
869 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  30.04 
 
 
861 aa  113  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.48 
 
 
851 aa  110  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  30.49 
 
 
866 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  30.56 
 
 
863 aa  109  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  30.49 
 
 
866 aa  109  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  30.49 
 
 
866 aa  109  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.02 
 
 
333 aa  108  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
848 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 
259 aa  105  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  33.48 
 
 
253 aa  105  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  30.08 
 
 
702 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  31.98 
 
 
259 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.61 
 
 
328 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  35.17 
 
 
338 aa  102  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.07 
 
 
376 aa  100  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.3 
 
 
327 aa  100  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.17 
 
 
338 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
253 aa  99.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  38.74 
 
 
224 aa  99.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
253 aa  99.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
266 aa  99  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  30.16 
 
 
253 aa  99  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>