More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78465 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  100 
 
 		 145 aa  300  6.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  77.62 
 
 		 155 aa  239  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  73.24 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  62.07 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  56.55 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  42.86 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  37.04 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  44.36 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  39.1 
 
 		 194 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  37.68 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  39.85 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  33.82 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  33.82 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  40.62 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  38.35 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  33.82 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  37.59 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  33.09 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  33.82 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  39.1 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  39.1 
 
 		 152 aa  100  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  37.41 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  39.1 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  37.6 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  36.62 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  37.14 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  37.5 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  38.03 
 
 		 151 aa  95.9  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  38.69 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  36.96 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  35.34 
 
 		 178 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  33.09 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  33.57 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  34.15 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  34.96 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  32.17 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  31.93 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  26.52 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  31.09 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  31.09 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  31.93 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  26.52 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  32.77 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  35.77 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  30.25 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  32.77 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  26.52 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0350  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3470  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.879267  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  25.19 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  31.09 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2736  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0075  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.679156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0371  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  28.03 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>