266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43994 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  100 
 
 		 942 aa  1945    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  29.46 
 
 		 764 aa  288  4e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  29.4 
 
 		 1092 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  34.93 
 
 		 1001 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  31.36 
 
 		 498 aa  197  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  30.45 
 
 		 892 aa  119  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  49.07 
 
 		 114 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  26.71 
 
 		 413 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  31.79 
 
 		 423 aa  110  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  30.63 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  29.29 
 
 		 422 aa  104  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  30.26 
 
 		 482 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  28.57 
 
 		 422 aa  102  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  30.26 
 
 		 484 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  28.57 
 
 		 421 aa  101  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  28.05 
 
 		 385 aa  100  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  29.35 
 
 		 484 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  31.56 
 
 		 481 aa  99  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  29.15 
 
 		 492 aa  99  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  32.91 
 
 		 437 aa  98.6  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  31.58 
 
 		 467 aa  96.3  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  28.68 
 
 		 476 aa  96.3  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  29.66 
 
 		 642 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  27.67 
 
 		 497 aa  91.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  30.34 
 
 		 418 aa  91.3  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  27.35 
 
 		 514 aa  89.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  27.19 
 
 		 500 aa  88.6  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  28.95 
 
 		 497 aa  88.2  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  24.18 
 
 		 1015 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  29.31 
 
 		 497 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  23.97 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  29.39 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  28.26 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  27.75 
 
 		 454 aa  84.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  27.59 
 
 		 451 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10917  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 1127 aa  75.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  24.32 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  25.76 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  24.1 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15652  predicted protein  23.99 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37378  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  27.97 
 
 		 289 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  22.44 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  23.67 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  24.51 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  23.55 
 
 		 329 aa  63.9  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  30.28 
 
 		 993 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  24.69 
 
 		 235 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  22.08 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.11 
 
 		 680 aa  62.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  23.53 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  38 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  23.61 
 
 		 326 aa  62  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  23.9 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  24.28 
 
 		 328 aa  60.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  22.92 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  24.05 
 
 		 325 aa  60.1  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  23.88 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  21.28 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  40.74 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.86 
 
 		 731 aa  58.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  43.21 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  24.79 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  39.29 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  41.98 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  39.53 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  33.33 
 
 		 726 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.64 
 
 		 691 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  21.85 
 
 		 322 aa  57  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  22.86 
 
 		 347 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  25.68 
 
 		 317 aa  57  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.55 
 
 		 680 aa  57  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  22.75 
 
 		 334 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  24.79 
 
 		 324 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  22.46 
 
 		 332 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  36.36 
 
 		 770 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  38.67 
 
 		 694 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  35.63 
 
 		 707 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  35.79 
 
 		 707 aa  56.2  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  21.89 
 
 		 321 aa  56.2  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  24.02 
 
 		 373 aa  55.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  36.36 
 
 		 683 aa  55.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  38.82 
 
 		 706 aa  55.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  42.11 
 
 		 674 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  22.92 
 
 		 322 aa  55.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  23.97 
 
 		 326 aa  55.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  32.26 
 
 		 663 aa  55.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  38.64 
 
 		 678 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  32.32 
 
 		 677 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  37.93 
 
 		 721 aa  54.7  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  37.08 
 
 		 673 aa  55.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  27.17 
 
 		 305 aa  54.7  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2841  DNA ligase, NAD-dependent  39.02 
 
 		 732 aa  54.7  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  39.02 
 
 		 670 aa  54.7  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.39 
 
 		 679 aa  54.7  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.5 
 
 		 774 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  39.02 
 
 		 673 aa  54.7  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  23.5 
 
 		 330 aa  54.3  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  38.37 
 
 		 711 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  39.51 
 
 		 683 aa  54.3  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>