More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9860 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9860  predicted protein  100 
 
 
318 aa  660    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37673  predicted protein  29.01 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0842145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 
696 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02030  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 
665 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0945136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.52 
 
 
947 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.33 
 
 
1363 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.83 
 
 
630 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 
1163 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.72 
 
 
1364 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 
1236 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.53 
 
 
1652 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.79 
 
 
865 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.76 
 
 
1164 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.19 
 
 
1221 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  26.44 
 
 
657 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.6 
 
 
1711 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.94 
 
 
737 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.61 
 
 
828 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25 
 
 
919 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.42 
 
 
664 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.21 
 
 
833 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 
1661 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.1 
 
 
1214 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.07 
 
 
716 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.05 
 
 
1760 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.89 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
1831 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.57 
 
 
1211 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.08 
 
 
742 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.71 
 
 
676 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 
1474 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1247 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.81 
 
 
1188 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00480  coatomer alpha subunit, putative  32.09 
 
 
1222 aa  69.7  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.01 
 
 
1188 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.47 
 
 
740 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.59 
 
 
540 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  35.29 
 
 
589 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.7 
 
 
1357 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 
1193 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.56 
 
 
1807 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.62 
 
 
1344 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.39 
 
 
1196 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.63 
 
 
1217 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 
1686 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.42 
 
 
677 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.46 
 
 
1523 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  32.23 
 
 
574 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  24.35 
 
 
1279 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.26 
 
 
1004 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  23.49 
 
 
578 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  24.35 
 
 
1279 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.51 
 
 
682 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.15 
 
 
1183 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.08 
 
 
930 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.43 
 
 
1161 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  22.74 
 
 
520 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 
1789 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  31.29 
 
 
511 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.43 
 
 
1161 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.12 
 
 
1552 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.91 
 
 
1262 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.08 
 
 
1190 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  25.68 
 
 
1270 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  38.83 
 
 
954 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.42 
 
 
1242 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 
652 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  26.54 
 
 
495 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.55 
 
 
675 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  34.95 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  33.65 
 
 
774 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.04 
 
 
757 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.87 
 
 
576 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.26 
 
 
1229 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.38 
 
 
792 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.12 
 
 
1858 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
1264 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.11 
 
 
1901 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.39 
 
 
1039 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  32.29 
 
 
1411 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  32.76 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23 
 
 
1477 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  33.8 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
1264 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  20.38 
 
 
782 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.95 
 
 
733 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.81 
 
 
1454 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  37.23 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  34.82 
 
 
780 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  37.23 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.46 
 
 
924 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.45 
 
 
596 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  32.69 
 
 
1205 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.97 
 
 
1617 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  24.37 
 
 
1280 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  30.77 
 
 
518 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>