More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56608 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_56608  predicted protein  100 
 
 
433 aa  895    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56588  predicted protein  50.44 
 
 
545 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0109  protochlorophyllide oxidoreductase  48.09 
 
 
323 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0190  light-dependent protochlorophyllide reductase  47.89 
 
 
321 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0294  protochlorophyllide oxidoreductase  46.75 
 
 
329 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.920312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4969  protochlorophyllide oxidoreductase  46.31 
 
 
325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1998  protochlorophyllide oxidoreductase  48.8 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3722  protochlorophyllide oxidoreductase  48.36 
 
 
320 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3774  protochlorophyllide oxidoreductase  48.36 
 
 
320 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2503  protochlorophyllide oxidoreductase  48.8 
 
 
321 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0476532  hitchhiker  0.00139691 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0740  protochlorophyllide oxidoreductase  45.32 
 
 
316 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1623  protochlorophyllide oxidoreductase  43.67 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.783305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05961  protochlorophyllide oxidoreductase  41.45 
 
 
337 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.641306 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4180  predicted protein  46.41 
 
 
328 aa  252  9.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0280434  decreased coverage  0.000647505 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1871  protochlorophyllide oxidoreductase  41.45 
 
 
337 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4160  protochlorophyllide oxidoreductase  41.39 
 
 
328 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.297736  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07921  protochlorophyllide oxidoreductase  41.81 
 
 
334 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05441  protochlorophyllide oxidoreductase  42.2 
 
 
338 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05981  protochlorophyllide oxidoreductase  38.9 
 
 
334 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05681  protochlorophyllide oxidoreductase  38.75 
 
 
334 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06061  protochlorophyllide oxidoreductase  38.68 
 
 
334 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.901695  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0542  protochlorophyllide oxidoreductase  37.85 
 
 
334 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  35.67 
 
 
330 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10309  dehydrogenase/reductase  32.54 
 
 
302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0691061  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  30.63 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.03 
 
 
294 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
312 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 
304 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
316 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 
300 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 
300 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 
300 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13231  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  26.93 
 
 
348 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
300 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
298 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
326 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1216  light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  28.7 
 
 
322 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  31.68 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
317 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43164  predicted protein  33.51 
 
 
298 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06971  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.75 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
315 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
298 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
324 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0074  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  29.34 
 
 
340 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.120468  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  33.74 
 
 
363 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  33.74 
 
 
363 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 
301 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 
298 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
307 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
301 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
299 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.53 
 
 
312 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 
320 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
317 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
305 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  31.06 
 
 
309 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.79 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06901  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  23.62 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.710368  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06611  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  23.84 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  33.05 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  33.05 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
303 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.64 
 
 
309 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
326 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0924  Protochlorophyllide reductase  32.13 
 
 
301 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
305 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 
306 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  33.48 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  26.69 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  28.51 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  30.64 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  28.99 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
320 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
318 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
279 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07001  putative light-dependent protochlorophyllide oxido-reductase  27.08 
 
 
333 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.825166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
313 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>