116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37283 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  100 
 
 		 1033 aa  2141    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  198  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  33.41 
 
 		 414 aa  196  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  31.67 
 
 		 430 aa  187  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 726 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  30.86 
 
 		 414 aa  174  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  30.86 
 
 		 414 aa  173  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  30.86 
 
 		 414 aa  174  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  33.52 
 
 		 575 aa  160  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  29.98 
 
 		 420 aa  158  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.38 
 
 		 541 aa  152  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.93 
 
 		 422 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.93 
 
 		 422 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.67 
 
 		 422 aa  148  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.12 
 
 		 412 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.84 
 
 		 424 aa  142  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 410 aa  128  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 410 aa  127  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.58 
 
 		 410 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.29 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.59 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.45 
 
 		 407 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  27.45 
 
 		 407 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.82 
 
 		 437 aa  74.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  27.94 
 
 		 402 aa  73.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  34.25 
 
 		 891 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.48 
 
 		 410 aa  70.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  32.88 
 
 		 904 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  32.88 
 
 		 912 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  32.19 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  32.19 
 
 		 896 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  32.19 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  32.19 
 
 		 924 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  32.19 
 
 		 926 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  29.38 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  28.93 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.32 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  28.93 
 
 		 900 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.21 
 
 		 403 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.78 
 
 		 432 aa  60.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  25.77 
 
 		 756 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.55 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.55 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.93 
 
 		 900 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  28.23 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.35 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.93 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  25.1 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  23.49 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.31 
 
 		 431 aa  57  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  24.37 
 
 		 419 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.89 
 
 		 419 aa  56.2  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.74 
 
 		 411 aa  55.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  24.7 
 
 		 420 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  26.24 
 
 		 424 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.9 
 
 		 410 aa  54.7  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  25.39 
 
 		 411 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.21 
 
 		 419 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.26 
 
 		 413 aa  53.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  23.41 
 
 		 440 aa  53.5  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.18 
 
 		 404 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  25.21 
 
 		 411 aa  53.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.25 
 
 		 437 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.25 
 
 		 424 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.91 
 
 		 425 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.26 
 
 		 410 aa  53.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  23.12 
 
 		 428 aa  52.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  23.74 
 
 		 420 aa  52  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.93 
 
 		 413 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.46 
 
 		 412 aa  51.6  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  26.61 
 
 		 424 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  25.82 
 
 		 382 aa  50.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.28 
 
 		 409 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.92 
 
 		 405 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.19 
 
 		 416 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.2 
 
 		 433 aa  48.5  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_985  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.6 
 
 		 1079 aa  47.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  22.62 
 
 		 404 aa  48.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  25.85 
 
 		 410 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  26.7 
 
 		 411 aa  48.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  23.73 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  28.83 
 
 		 1179 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  25.9 
 
 		 401 aa  47.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.76 
 
 		 405 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_002950  PG0530  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.73 
 
 		 1075 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.38 
 
 		 1067 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  22.71 
 
 		 411 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  29.81 
 
 		 394 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.94 
 
 		 1066 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.13 
 
 		 423 aa  47  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  26.21 
 
 		 424 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.2 
 
 		 408 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  22.63 
 
 		 2211 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1067 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0615  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.08 
 
 		 1064 aa  46.2  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.120313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  26.21 
 
 		 424 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.08 
 
 		 423 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25.32 
 
 		 436 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  25.88 
 
 		 403 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.33 
 
 		 426 aa  45.8  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>