192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1874 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  38.98 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  43.7 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  39.83 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  33.9 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  40.16 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  44.63 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  39.64 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  40.35 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  41.18 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.82 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  34.51 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.04 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.67 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.82 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.17 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.18 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  40.16 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.18 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  32.74 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.9 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  40.87 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  43.48 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  39.22 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  36.15 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  34.95 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.52 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.29 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  35.79 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  37.23 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  37.72 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  40.87 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  40.87 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  33.61 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  34.21 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  40.4 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  36.84 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.82 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.17 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  39.29 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  34.51 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  37 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  30.36 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  37.38 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  36.46 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  36.59 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  35.78 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  28.7 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  35.54 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  38.61 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3909  hypothetical protein  33.87 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181431  normal  0.486883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  33.67 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  30.09 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  34.31 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1509  hypothetical protein  32.71 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  49.23 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  41.28 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  29.46 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  33.62 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40.57 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  39.45 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  34.04 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  34.96 
 
 		 137 aa  57  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.78 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  31.09 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.29 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0671  hypothetical protein  34.78 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  32.04 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  34.78 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  35 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  34.51 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  34.51 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  34.95 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  35.34 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  32.5 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  34 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  33.33 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  32.26 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  35.34 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>