84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1212 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1212  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  682    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 927 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 1694 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.88 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 4079 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 740 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3687  tetratricopeptide TPR_2  23.17 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 643 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.99 
 
 		 1979 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1927  tetratricopeptide TPR_2  22.76 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.48 
 
 		 706 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 747 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 673 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 860 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1138 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 605 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.11 
 
 		 632 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1085 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.26 
 
 		 795 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.5 
 
 		 865 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.75 
 
 		 745 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 804 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.41 
 
 		 462 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 594 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 1192 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 878 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  25.56 
 
 		 632 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  24.24 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.8 
 
 		 550 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 884 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 955 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  23.65 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1069 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.64 
 
 		 864 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 771 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 366 aa  46.2  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 373 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 3145 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 968 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1276 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.18 
 
 		 729 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1827 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.57 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 617 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 699 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.03 
 
 		 810 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 649 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.09 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  33.02 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 601 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 683 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.74 
 
 		 561 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.87 
 
 		 576 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.55 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  28.72 
 
 		 612 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 784 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1782  hypothetical protein  34.12 
 
 		 144 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 804 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.91 
 
 		 561 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2021  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 572 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1967  TPR domain-containing protein  26.46 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 1178 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.06 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 883 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  27.22 
 
 		 584 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 466 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.9 
 
 		 882 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 416 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 254 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 3301 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 792 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 3560 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1650  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 460 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  34.67 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>