More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5359 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  82.89 
 
 		 193 aa  326  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  50.26 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2413  integrase family protein  51.67 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  41.18 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  41.18 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  41.18 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  41.18 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  43.65 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  43.65 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  43.65 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  43.65 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  43.65 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  39.46 
 
 		 209 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  43.83 
 
 		 183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  42.54 
 
 		 188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  42.54 
 
 		 188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  42.54 
 
 		 188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2871  integrase family protein  38.62 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1056  integrase family protein  38.8 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0180759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2409  integrase family protein  38.8 
 
 		 197 aa  131  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  38.85 
 
 		 173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  38.8 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  39.13 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  37.97 
 
 		 159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4235  integrase family protein  41.72 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.407611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.5 
 
 		 295 aa  95.1  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 308 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  31.07 
 
 		 320 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.97 
 
 		 302 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  30.48 
 
 		 296 aa  85.1  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  37.13 
 
 		 332 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  30.69 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2415  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  32.8 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  30.11 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  32.07 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  31.67 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  32.24 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.22 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  30.82 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33.15 
 
 		 304 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.62 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2821  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.83 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.626713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.31 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.37 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  31.43 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  30.58 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  29.7 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.14 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  30.15 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.25 
 
 		 296 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  28.16 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.85 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.37 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.19 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.51 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.1 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  34.93 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  28.66 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.81 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  32.2 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  32.2 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  32.2 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.04 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  32.26 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>