210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  100 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  98.79 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  74.23 
 
 		 166 aa  247  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  63.03 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  63.19 
 
 		 165 aa  217  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  63.19 
 
 		 165 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  63.19 
 
 		 165 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  60.74 
 
 		 165 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  59.51 
 
 		 164 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  60.13 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  32.28 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  34.62 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  33.12 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  29.3 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  28.85 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  24.7 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1146  UspA domain protein  30.63 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.19 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  31.61 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.3 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.56 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  28.09 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  26.75 
 
 		 283 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.94 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  31.01 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 278 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  25.64 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  27.27 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  29.45 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  24.2 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  29.3 
 
 		 289 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  26.62 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.03 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  29.49 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  25.66 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  27.39 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.85 
 
 		 290 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  30.82 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  30.82 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.39 
 
 		 301 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.49 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.3 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.01 
 
 		 320 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  35 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  25.16 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  27.74 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  22.84 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  25.44 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  24.69 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  25.49 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.1 
 
 		 297 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  24.52 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  24.2 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  29.3 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  27.61 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  25.81 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  28.39 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  24.36 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.66 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.31 
 
 		 275 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  25.81 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 300 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 297 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  24.36 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  24.36 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  28.92 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  30.52 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  25.16 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  25 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>