242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04101 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  100 
 
 		 394 aa  807    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  52.99 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  51.43 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 398 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 379 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  27.04 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  27.04 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  27.04 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  24.26 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  27.62 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  24.37 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  24.24 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  25.51 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  27.16 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  24.12 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  24.74 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  24.37 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  23.97 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  24.43 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  24.43 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  24.43 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  24.68 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  24.68 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  24.68 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  24.24 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  24.49 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  25.92 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  23.1 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  23.95 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  23.41 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  23.73 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  23.66 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  23.36 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  26.3 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  26.26 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.8 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  23.27 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  23.66 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  22.58 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  25.26 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  23.39 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  25.68 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  25.87 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  22.28 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  24.43 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  23.29 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  21.63 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  25.19 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  22.77 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  22.28 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  21.17 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  23.45 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  24.09 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  23.77 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  25.51 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  22.6 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  19.75 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  22.5 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.91 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  22.36 
 
 		 806 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  21.46 
 
 		 805 aa  57  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  20.36 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  22.94 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.27 
 
 		 857 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.13 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  23.23 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.88 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.11 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  24.28 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  20.76 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>