More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18841 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  100 
 
 
275 aa  554  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  90.91 
 
 
275 aa  507  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  89.45 
 
 
275 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18841  aminotransferases class-IV  64.73 
 
 
275 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  47.39 
 
 
275 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  46.64 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  41.09 
 
 
276 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  38.89 
 
 
286 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  37 
 
 
270 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  34.43 
 
 
270 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  26.85 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  26.42 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25 
 
 
288 aa  95.5  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  26.58 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  29.13 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  24.52 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.73 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  24.62 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  26.39 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  27.04 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  24.63 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  24.25 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  23.39 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  26.85 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  25.36 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.44 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  26.32 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  25.23 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  24.25 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  22.49 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  25.79 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  22.35 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  24.11 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  23.48 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  26.57 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  25.96 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  23.38 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  25.2 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  26.56 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.56 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  26.89 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  26.56 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  26.56 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.25 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.43 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  25.98 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  24.62 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.48 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  25.21 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  21.43 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  26.79 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  23.94 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.34 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  23.4 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  25.57 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  26.32 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  23.56 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  28.38 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  28.38 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  23.79 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  23.66 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  23.18 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  23.49 
 
 
311 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.81 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.46 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  24.3 
 
 
282 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  30.57 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  23.39 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  23.08 
 
 
299 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.62 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 
299 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  24.19 
 
 
292 aa  62.4  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.73 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  26.24 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  23.31 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.54 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  24.02 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.41 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.18 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.98 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>