More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2481 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5606  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0545512  normal  0.986843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  24.9 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  24.9 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  24.9 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  24.9 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  24.9 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.9 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  24.9 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.89 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.89 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.89 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.89 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.89 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1147  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  25.1 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0420293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3571  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  24.41 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000174355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1094  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  24.41 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  25.3 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0837  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  25 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  27.31 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4065  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0188  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  26.54 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  46.25 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1050  transcriptional regulator, AraC family  22.11 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  20.32 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.36 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  40 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2690  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  34.12 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  34.12 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1161  transcriptional regulator, AraC family  39.47 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000709496  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 347 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.44 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1107  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1060  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2729  AraC family transcription regulator  35.8 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>