67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1002 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  100 
 
 		 260 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  41.89 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  30.41 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  40 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  31.58 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  39.47 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  30.71 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  35.8 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  35.48 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  35.14 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  32.89 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  33.33 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.7 
 
 		 459 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  31.58 
 
 		 137 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.58 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  34.31 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  34.48 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  34.62 
 
 		 170 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  34.62 
 
 		 170 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  29.73 
 
 		 121 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  32.88 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  35.53 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2818  hypothetical protein  33.78 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.654344  hitchhiker  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  36.99 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.46 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  32.89 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  31.58 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  35.53 
 
 		 413 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30.67 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.07 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  35.53 
 
 		 466 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  33.33 
 
 		 390 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  31.87 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  28.05 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  30.67 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  28.57 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  30.38 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  28.57 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  30.38 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  28.57 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  30.38 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  29.17 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  36.49 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  33.33 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  33.33 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.38 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.53 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  36.62 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  31.65 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  28.42 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  28.4 
 
 		 308 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  32.73 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.91 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  25.32 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  29.87 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  33.72 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  35.14 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  32.89 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  27.71 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  33.33 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  28.95 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  33.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  27.71 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  30.77 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  30.49 
 
 		 391 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  34.33 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>