More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0654 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 319 aa  621  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  35.69 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  34.11 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  32.39 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  30.86 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  33.23 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.68 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.77 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.01 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  35.07 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  36.49 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  34.16 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  31.66 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.56 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.31 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.21 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.9 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  35.27 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  34.21 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.91 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  27.43 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  31.96 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  31.68 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  30.7 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 353 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  32.03 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.74 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.87 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.19 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  33.84 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  32.38 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.23 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  34.1 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  34.72 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.55 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  30.41 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  36.49 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  32.63 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  31.23 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  35.85 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  24.36 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.87 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.07 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.25 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  29.06 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  25.57 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  34.26 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  30.65 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.63 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  29.06 
 
 		 377 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  30.3 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  26.89 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  31.33 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  29.51 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  26.86 
 
 		 342 aa  99  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  30.74 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.74 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  34.34 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.78 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  29.24 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  35.64 
 
 		 375 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.9 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  32.37 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  29.08 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  35.03 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  31.37 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  34.36 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.06 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  34.1 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  24.78 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  29.65 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  25 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  32.26 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  28.1 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  27.97 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  28.17 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  29.91 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  32.84 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  26.76 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  32.02 
 
 		 383 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.58 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  30.73 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  37.11 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  26.91 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  26.22 
 
 		 354 aa  92.8  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  30.84 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  29.84 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>