116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4338 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 269 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  53.94 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  53.94 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  53.94 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  53.94 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  53.94 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  51.57 
 
 		 309 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  53.94 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  53.94 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  53.94 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  53.94 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  53.54 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  53.54 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  53.94 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  53.54 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  53.15 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  52.59 
 
 		 278 aa  278  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  51.12 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  47.76 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  50.56 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  43.17 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  48.13 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  43.66 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  47.39 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  47.39 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  46.64 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  46.47 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  46.84 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  41.9 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  41.22 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  39.54 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  39.83 
 
 		 289 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  38.46 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  36.23 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  36.68 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  36.12 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  35.64 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  39.91 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  38.77 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  37.89 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  37.89 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  36.36 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  32.39 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  31.18 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  30.17 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  29.87 
 
 		 625 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  29.52 
 
 		 732 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  28.76 
 
 		 604 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  29.67 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  25.94 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  28.73 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  29.46 
 
 		 361 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  21.18 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  24.35 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  24.54 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  25.15 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  25.2 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  24.5 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  24.5 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  24.8 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  24.8 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  24.8 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  24.8 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  24.8 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  25.53 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  24.8 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  26.11 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  24.8 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  24.86 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  25.56 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  22.03 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  26.4 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  22.55 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  22.55 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  22.55 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  28.33 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  26.85 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  25.25 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  20.67 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  21.81 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  22.83 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  22.68 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  26.63 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  24.86 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  27.81 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  23.71 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  21.94 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  25 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  23.97 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  24.21 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  24.26 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  22.14 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47526  Probable formate transporter 1 (Formate channel 1)  23.87 
 
 		 444 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  24.74 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  24.55 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  26.51 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  23.59 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  22.14 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  27.07 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  19.69 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>