More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38397 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38397  predicted protein  100 
 
 
324 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.504345  hitchhiker  0.00204259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 
316 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  34.71 
 
 
320 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
332 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
315 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  33.44 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.29 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  30.79 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
300 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
300 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
341 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
300 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  30.61 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.75 
 
 
343 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
304 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
292 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
331 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 
303 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
324 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
339 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
280 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
307 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
312 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  30.63 
 
 
311 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
341 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
317 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  32.46 
 
 
301 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  31.32 
 
 
318 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
312 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  32.34 
 
 
308 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
288 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
310 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 
268 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
305 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
318 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  31.33 
 
 
321 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  30.48 
 
 
342 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 
305 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
311 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
339 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 
331 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  30.7 
 
 
321 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
287 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
328 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
322 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.29 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  30.82 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  30.82 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  30.82 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 
302 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
320 aa  92.8  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.29 
 
 
326 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 
317 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  30.07 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  33.01 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 
270 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.02424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  31.72 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  33.07 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  28.21 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  29.04 
 
 
309 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
284 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  30.85 
 
 
300 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>