More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0669 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0669  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  56.33 
 
 		 739 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.55 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.12 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.12 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.59 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  45.06 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  44.1 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  45.89 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  44.96 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45.8 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.7 
 
 		 484 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.42 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.42 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  40.34 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  43.29 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.81 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  42.92 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  45.15 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  43.91 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.06 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.22 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  43.91 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  42.53 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  43.91 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  46.78 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  44.21 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  43.04 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  41.63 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.13 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  41.99 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  42.61 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.63 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  42.61 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  42.49 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1207  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  41.81 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  41.03 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  41.88 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  38.96 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  41.35 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  43.35 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  40.66 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.19 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  46.23 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  41.63 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  39.66 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  42.06 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  43.93 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  42.24 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3321  ABC transporter related  41.42 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.77 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  41.2 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  44.83 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2850  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71791  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  41.3 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  41.77 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  44.08 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  41.77 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  40.77 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1294  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  41.81 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.98 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  41.77 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  41.2 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  38.2 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  41.35 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  41.81 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  40.51 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  41.98 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.83 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.67 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  41.63 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  40.09 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  41.2 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  40.93 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  44.17 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  38.53 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.49 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  40.17 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  36.91 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>