More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0739 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
668 aa  1381    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  42.57 
 
 
705 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  42.28 
 
 
648 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.71 
 
 
661 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.62 
 
 
649 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  38.01 
 
 
683 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  38.8 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  38.96 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  38.96 
 
 
683 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  38.8 
 
 
683 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  38.96 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  38.8 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  38.8 
 
 
683 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  38.8 
 
 
683 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  38.8 
 
 
683 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  38.05 
 
 
681 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  40.16 
 
 
677 aa  412  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.04 
 
 
683 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.51 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 
618 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  37.89 
 
 
704 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 
656 aa  392  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  38.36 
 
 
860 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.83 
 
 
667 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 
853 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.63 
 
 
643 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 
646 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.76 
 
 
693 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.26 
 
 
806 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.52 
 
 
751 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.53 
 
 
775 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.38 
 
 
761 aa  379  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36.73 
 
 
776 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.38 
 
 
905 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.63 
 
 
765 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 
643 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 
643 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.99 
 
 
734 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  36.44 
 
 
843 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.05 
 
 
714 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.99 
 
 
701 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  34.95 
 
 
744 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  35.62 
 
 
640 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 
712 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.73 
 
 
714 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  36.4 
 
 
861 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 
648 aa  360  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  38.84 
 
 
739 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  36.81 
 
 
741 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.27 
 
 
727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.27 
 
 
727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  37.33 
 
 
770 aa  356  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  35.43 
 
 
855 aa  356  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.77 
 
 
734 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  38.18 
 
 
732 aa  355  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.89 
 
 
833 aa  355  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.76 
 
 
625 aa  354  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.84 
 
 
654 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  37 
 
 
723 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 
728 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  36.27 
 
 
779 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  37.58 
 
 
735 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  32.81 
 
 
829 aa  350  7e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.79 
 
 
640 aa  349  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 
720 aa  348  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.93 
 
 
720 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  36.23 
 
 
776 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 
728 aa  347  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  34.12 
 
 
824 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 
757 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 
811 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  35.57 
 
 
952 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.96 
 
 
712 aa  342  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 
750 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.48 
 
 
761 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 
691 aa  337  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 
730 aa  337  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 
763 aa  336  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  33.09 
 
 
828 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 
626 aa  334  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.25 
 
 
712 aa  333  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  33.57 
 
 
941 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
795 aa  334  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  38.87 
 
 
796 aa  333  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.56 
 
 
755 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  32.55 
 
 
814 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  35.08 
 
 
732 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
801 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 
766 aa  330  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  33.48 
 
 
676 aa  328  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  34.92 
 
 
727 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  38.58 
 
 
709 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  34.93 
 
 
651 aa  327  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  33.43 
 
 
774 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.27 
 
 
705 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 
656 aa  324  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  32.3 
 
 
750 aa  323  6e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.74 
 
 
707 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  33.94 
 
 
757 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>