More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3816 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
228 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
273 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218098  normal  0.0212741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
298 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.78 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1357  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.35686e-16  hitchhiker  0.0000092144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  34.63 
 
 
265 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  34.18 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
286 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0263  putative short chain dehydrogenase  30.11 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  26.7 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  26.18 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1312  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
327 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1484  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.49 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 
286 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  37.69 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  36.08 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.31 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.67 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.2 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0626864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  29.06 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  34.27 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  40.87 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.607483  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  34.27 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  32.48 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  35.53 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>