More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4603 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
262 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227538  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218098  normal  0.0212741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
280 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
290 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
273 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0263  putative short chain dehydrogenase  23.9 
 
 
278 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390771  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1312  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.78 
 
 
245 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
297 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
252 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
256 aa  99  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
588 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  38.34 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
250 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.5 
 
 
245 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
247 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
274 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
256 aa  92.8  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
250 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
288 aa  92  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1484  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 
238 aa  92  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2371  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase / Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
248 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
247 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.5 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.62 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.58 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  36.73 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.58 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
588 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
588 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
588 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.58 
 
 
246 aa  89  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.88 
 
 
252 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
246 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.58 
 
 
246 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
252 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
602 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 
592 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
275 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 
602 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
259 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  89  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.639156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.29 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  34.03 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
602 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
277 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
253 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.3 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.67 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.3 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  37.44 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>