More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3034 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  62.89 
 
 		 602 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  57.02 
 
 		 589 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  62.41 
 
 		 613 aa  698    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  100 
 
 		 597 aa  1170    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  62.93 
 
 		 608 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  55.76 
 
 		 671 aa  628  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  57.24 
 
 		 625 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  53.27 
 
 		 726 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  57.4 
 
 		 638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  57.63 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 609 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  57.07 
 
 		 625 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  50.42 
 
 		 610 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.55 
 
 		 617 aa  510  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.41 
 
 		 606 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.78 
 
 		 730 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  46.97 
 
 		 605 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  49.33 
 
 		 608 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  42.83 
 
 		 584 aa  409  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  41.85 
 
 		 984 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.52 
 
 		 594 aa  289  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.59 
 
 		 585 aa  277  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  28.89 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.75 
 
 		 578 aa  266  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.72 
 
 		 575 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.87 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  31.25 
 
 		 578 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  35.71 
 
 		 631 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  28.06 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  29.27 
 
 		 592 aa  264  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.97 
 
 		 585 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  29.16 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 		 604 aa  260  6e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  30.4 
 
 		 585 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  32.26 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.52 
 
 		 582 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  36.83 
 
 		 1284 aa  257  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.02 
 
 		 586 aa  256  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.39 
 
 		 589 aa  256  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.05 
 
 		 636 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  32.95 
 
 		 583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.73 
 
 		 1522 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.35 
 
 		 1257 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  35.88 
 
 		 1321 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.76 
 
 		 593 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  38.01 
 
 		 1218 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  38.23 
 
 		 1218 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  38.01 
 
 		 1218 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  38.01 
 
 		 1218 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  38.4 
 
 		 1231 aa  253  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  32.36 
 
 		 625 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.08 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  35.77 
 
 		 633 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.6 
 
 		 578 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.6 
 
 		 578 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.11 
 
 		 654 aa  251  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.92 
 
 		 606 aa  250  6e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  32.29 
 
 		 577 aa  250  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  31.89 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.4 
 
 		 606 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  32.1 
 
 		 577 aa  249  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  31.85 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  30.39 
 
 		 587 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  34.87 
 
 		 1218 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  33.83 
 
 		 606 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  32.59 
 
 		 695 aa  247  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.68 
 
 		 577 aa  247  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  32.1 
 
 		 733 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.52 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.34 
 
 		 601 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  31.5 
 
 		 604 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 628 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  36.99 
 
 		 578 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  30.69 
 
 		 577 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  33.14 
 
 		 572 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.32 
 
 		 593 aa  244  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.27 
 
 		 652 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31.82 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.08 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.06 
 
 		 622 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.08 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  29.62 
 
 		 588 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  28.14 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.48 
 
 		 641 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  32.89 
 
 		 595 aa  243  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.26 
 
 		 672 aa  243  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  31.11 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  34.54 
 
 		 636 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.48 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  30.75 
 
 		 604 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  28.8 
 
 		 587 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  31.25 
 
 		 610 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.27 
 
 		 627 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.28 
 
 		 573 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  37.92 
 
 		 589 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  27.82 
 
 		 589 aa  241  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>