More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1067 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  100 
 
 		 346 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  58.71 
 
 		 358 aa  348  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  55.56 
 
 		 369 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  59.49 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  57.34 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  58.36 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  58.36 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  58.36 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  53.93 
 
 		 372 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  55.23 
 
 		 347 aa  311  9e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  55.08 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  53.67 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  49.7 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 367 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  56.7 
 
 		 391 aa  251  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.97 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  45.89 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  47.94 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  46.05 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  46.33 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  45.27 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  47.99 
 
 		 335 aa  225  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  50.7 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  47.04 
 
 		 344 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  42.46 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  51.24 
 
 		 219 aa  209  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  31.78 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.62 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  36.13 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  45.72 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  33.14 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  34 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  36.98 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  38.42 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.69 
 
 		 378 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  32.27 
 
 		 348 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  40.25 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  45.91 
 
 		 308 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  42.28 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  43.38 
 
 		 389 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.88 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  44.31 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  38.42 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  42.71 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  34.23 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2208  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  53.96 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.01 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.28 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.72 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.08 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  37.54 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.63 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.34 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  40.5 
 
 		 352 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 368 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.81 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 387 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  40.29 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  34.75 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.72 
 
 		 371 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.78 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 353 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  39.14 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.24 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  39.33 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  38.52 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  38.02 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.7 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.97 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  33.97 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.04 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  36.56 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.49 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.59 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.92 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  42.73 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>