More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0853 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0853  inner-membrane translocator  100 
 
 		 341 aa  646    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229502  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 346 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  37.07 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  36 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  36.33 
 
 		 840 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  35.11 
 
 		 852 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  32.65 
 
 		 838 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  33.02 
 
 		 594 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  33.03 
 
 		 597 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3319  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0364  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  30 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  37.26 
 
 		 840 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2035  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.226919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 652 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  30.45 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1805  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  36.24 
 
 		 840 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.62 
 
 		 646 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.78 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 637 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  33.22 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1770  branched chain amino acid ABC transporter, permease  29.21 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1753  branched chain amino acid ABC transporter, permease  30.72 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.20801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  33.19 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 646 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3726  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2714  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00849932  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>