More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1416 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  46.77 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  48.59 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.61 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  43.8 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.31 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  43.63 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  44.31 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.64 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.22 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.16 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.21 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  41.54 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.08 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.7 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  41.32 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  41.18 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  40.94 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  39.77 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.6 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.94 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  37.4 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.34 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.35 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  40.41 
 
 		 309 aa  194  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  37.25 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  39.23 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  37.8 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.74 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.74 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  38.78 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  39.2 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.77 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  38.04 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  39.37 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  38.67 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  38.91 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  39.16 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  35.51 
 
 		 282 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  38.7 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.58 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  39.53 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.03 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.59 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.3 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  39.67 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  37.28 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.47 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  41.28 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  36.86 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.63 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  42.5 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  35.83 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  35.44 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  37.19 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  36.47 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.46 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 		 325 aa  178  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.59 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  35.66 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.34 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  38.66 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  38.13 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  36.08 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.43 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.68 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.4 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.47 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  34.85 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  36.89 
 
 		 264 aa  174  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  36.63 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>