73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5537 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 744 aa  1431    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  31.03 
 
 		 864 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  31.17 
 
 		 865 aa  184  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1147  Fibronectin type III domain protein  28.12 
 
 		 979 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.478266  hitchhiker  0.000177205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  25.7 
 
 		 822 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0633  hypothetical protein  30.13 
 
 		 579 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00895594  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.56 
 
 		 9585 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1148  Fibronectin type III domain protein  28.55 
 
 		 955 aa  79.7  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.950672  decreased coverage  0.0000360258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  35.17 
 
 		 1879 aa  68.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  35.71 
 
 		 2039 aa  67.8  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  30.28 
 
 		 2047 aa  65.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  34.76 
 
 		 2084 aa  65.1  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.18 
 
 		 3911 aa  64.3  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  26.67 
 
 		 725 aa  64.3  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4250  hypothetical protein  27.44 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  33.77 
 
 		 762 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  29.64 
 
 		 2027 aa  61.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  33.73 
 
 		 1633 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  30.13 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  33.19 
 
 		 683 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  33.53 
 
 		 1067 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  34.29 
 
 		 656 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 		 1795 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  35.34 
 
 		 3802 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  26.83 
 
 		 667 aa  55.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  25.96 
 
 		 2067 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  36.09 
 
 		 2052 aa  54.3  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  26.33 
 
 		 2056 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  23.51 
 
 		 1172 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  45.71 
 
 		 2069 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  33.71 
 
 		 938 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  36.9 
 
 		 277 aa  52  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.55 
 
 		 795 aa  50.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.4 
 
 		 2042 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25 
 
 		 2068 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.16 
 
 		 2170 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  39.56 
 
 		 2522 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  32.48 
 
 		 1462 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  29.2 
 
 		 1973 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  28.99 
 
 		 2040 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  31.94 
 
 		 680 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  28.14 
 
 		 2011 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1994 aa  48.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  26.73 
 
 		 428 aa  47.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  35.09 
 
 		 1199 aa  47.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  30.22 
 
 		 801 aa  47.8  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  34.07 
 
 		 1007 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.87 
 
 		 3544 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  32.7 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  25.69 
 
 		 1052 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.84 
 
 		 1628 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4301  Fibronectin type III domain protein  24.56 
 
 		 1799 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130951  decreased coverage  0.00087761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  32.99 
 
 		 613 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.81 
 
 		 3333 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  33.11 
 
 		 1880 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.35 
 
 		 445 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 701 aa  46.6  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  34.59 
 
 		 1625 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  24.57 
 
 		 480 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  27.64 
 
 		 917 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  32.08 
 
 		 1017 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.47 
 
 		 1848 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  34.19 
 
 		 2043 aa  45.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4291  Fibronectin type III domain protein  25.58 
 
 		 2603 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  40.22 
 
 		 655 aa  44.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  32.84 
 
 		 768 aa  44.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  29.14 
 
 		 1065 aa  44.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.57 
 
 		 6885 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  30.59 
 
 		 651 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 2476 aa  43.9  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  27.65 
 
 		 771 aa  43.9  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  25.62 
 
 		 804 aa  43.9  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.53 
 
 		 729 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>