More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1136 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  696    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  41.23 
 
 		 489 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2704  beta-lactamase  36.55 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  41.99 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  36.07 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5304  beta-lactamase  35.45 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  37.77 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  37.24 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  34.39 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  32.22 
 
 		 494 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.01 
 
 		 595 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.21 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  28.71 
 
 		 491 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.92 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  29.13 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  21.83 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  26.84 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  22.74 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  28.43 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  26.64 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  36.82 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  36.82 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.04 
 
 		 650 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  28.2 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.4 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  32.87 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  29.61 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.95 
 
 		 601 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  22.84 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  36.45 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  25.47 
 
 		 720 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.02 
 
 		 437 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.15 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.57 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  29.3 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  29.52 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  30.49 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  24.48 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  24.66 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.47 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.23 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.24 
 
 		 497 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  30.29 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.08 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  27.51 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1219  beta-lactamase  23.93 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.64 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  27.7 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  30.3 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.02 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  29.53 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  26.39 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.5 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  34.08 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  27.65 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  24.2 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  24.68 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  32.34 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.44 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.55 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  34.72 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  23.3 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.77 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  26.62 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  26.55 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.96 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.91 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.58 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  29.86 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  23.3 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  23.4 
 
 		 395 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  32.84 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  35.33 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  24.82 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.37 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.06 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  28.31 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  25.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  24.93 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  26.92 
 
 		 740 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  30.49 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  25.83 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  23.3 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.66 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.47 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  27.14 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  27.54 
 
 		 5698 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  27.37 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  30.32 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  27.59 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.31 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  26.95 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>