More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2936 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 546 aa  1062    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  53.58 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  53.31 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  51.01 
 
 		 530 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  51.01 
 
 		 530 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  50.83 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  49.18 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  49.08 
 
 		 526 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  50.28 
 
 		 526 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  48.7 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  47.9 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  48.98 
 
 		 520 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  45.45 
 
 		 542 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.72 
 
 		 539 aa  364  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  44.32 
 
 		 558 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  45.37 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  43.77 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  46.77 
 
 		 548 aa  336  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  42.57 
 
 		 521 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  41.82 
 
 		 512 aa  323  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  47.39 
 
 		 547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  39.31 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  42.08 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  44.85 
 
 		 563 aa  297  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  47 
 
 		 513 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  36.67 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 520 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.92 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  34.71 
 
 		 539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.26 
 
 		 568 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.19 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.8 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 583 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  32.85 
 
 		 554 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.49 
 
 		 533 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 527 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 543 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.2 
 
 		 532 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.48 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  32.84 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.13 
 
 		 546 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.93 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.67 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.76 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 537 aa  133  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  28.69 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 619 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.63 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.27 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.57 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.87 
 
 		 579 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.57 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 552 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.78 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.73 
 
 		 544 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.67 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  24.33 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 540 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.12 
 
 		 565 aa  120  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.89 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.9 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30.75 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  31.7 
 
 		 492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.76 
 
 		 557 aa  116  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.84 
 
 		 549 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.02 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.67 
 
 		 552 aa  114  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  30.42 
 
 		 501 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.74 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.31 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.47 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.29 
 
 		 544 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  24.07 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  31.72 
 
 		 536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  25.91 
 
 		 545 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  32.44 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 548 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.84 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.09 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.46 
 
 		 545 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.95 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  23.66 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.31 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.79 
 
 		 544 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  23.66 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.2 
 
 		 556 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.37 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.84 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 620 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.56 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>