144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2269 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  50.2 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  45.49 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  47.1 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  48.05 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  48.61 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  49.6 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  47.31 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.69 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  48.41 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  51 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  46.96 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  41.9 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  44.36 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  50.81 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  44.96 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  44.96 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  44.96 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  44.83 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  47.13 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.36 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  42.31 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.69 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.57 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  42.16 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  38.17 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.75 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  49.79 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  46.86 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  46.99 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.56 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.09 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.84 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.81 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.63 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.54 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.52 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.84 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  26.91 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.91 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.68 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.89 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  29.05 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.12 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.44 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.32 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  31.08 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.77 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.34 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 358 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.32 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>