More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3144 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  43.69 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3829  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  40.8 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  44.12 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4619  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.167951  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4453  response regulator receiver  40 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0485  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  38.24 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4917  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4967  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103677  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  37.68 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4923  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4137  response regulator receiver  40.39 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4505  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  42.16 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  36.45 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  35.81 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 205 aa  138  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.92 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  36.76 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  38.05 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  36.23 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  35.47 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  35.47 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  35.47 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  35.47 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8027  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982767  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  36.54 
 
 		 282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1904  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0420846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  37.25 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  37.07 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  37.07 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  34.98 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  35.61 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  35.92 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.7 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  35.96 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  37.44 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  36.1 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  36.1 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  36.1 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  34.98 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  36.1 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  35.96 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  36.59 
 
 		 220 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  39.2 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  36.1 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35.12 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>