133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1250 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  53.97 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  47.5 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  43.67 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  44.64 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  44.64 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  41.56 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  44.86 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  43.39 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  40.09 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  45.12 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  44.73 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  47.35 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  44.44 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  42.8 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  45.18 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  41.35 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  40 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  41.42 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  46.54 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  38 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  40.6 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  45.75 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  45.25 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  41.95 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  42.06 
 
 		 233 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  41.86 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  37.87 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  40.6 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  40 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  44.55 
 
 		 278 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  39.64 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  37.07 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  40.6 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  39.39 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  39.45 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  41.06 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  35.39 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  45.21 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  34.55 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  45.27 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  36.64 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  38.46 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  39.48 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  37.5 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  37.5 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  41.94 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  36.78 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  41.3 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  36.7 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  33.18 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  35.11 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  35.37 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  35.5 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  35.5 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  34.32 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  33.89 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  34.33 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  32.24 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  27.93 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  33.2 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.84 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  28.19 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  31.8 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  29.91 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  30.34 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  29.51 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  28.11 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  36.52 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  36.97 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  36.13 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  36.13 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  36.13 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  36.13 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  36.13 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  30.36 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.96 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  28.63 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  32.48 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  23.56 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.92 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  28.39 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.05 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  30.84 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  25.84 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  33.08 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  31.8 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.25 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  30.13 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  32.26 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  26.87 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  25.44 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30.21 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  34.65 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  25.89 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  25.88 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.65 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  33.02 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  34.17 
 
 		 347 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  33.87 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>